ZOOM Lite adalah generasi pemetaan Data sequencing dan visualisasi software. Genom pengguna masukan referensi dan Illumina / Solexa singkat membaca file atau AB ruang warna solid membaca file dalam berbagai format, seperti * .fasta, * .fastq, * _seq.txt, * .csfasta dll ZOOM output hasil pemetaan ini singkat membaca pada urutan referensi. ZOOM Lite memiliki cepat dan akurat kernel pemetaan berdasarkan pada teori baru dirancang beberapa spasi biji. Kedua single-end dan dipasangkan-akhir berbunyi dari berbagai panjang dari 15bp ke 240bp dapat ditangani. Sejumlah ketidaksesuaian dan satu penyisipan / penghapusan berbagai panjang antara membaca dan sasaran wilayah pada urutan referensi diperbolehkan. Hasil unik dipetakan atau terbaik (top N) hasil untuk setiap membaca akan dilaporkan sesuai dengan ketidaksesuaian minimal dan panjang INDEL. Skor kualitas yang digunakan untuk meningkatkan akurasi pemetaan. Berdasarkan kernel pemetaan, ZOOM Lite memungkinkan pengguna untuk memuat membaca data lokal dan urutan referensi data, pilih parameter yang tepat, data volume tinggi proses secara paralel antara hingga empat CPU, memonitor tugas-tugas berjalan, menyimpan hasil pemetaan, melihat grafik Hasil pemetaan dan hasil pemetaan keluaran baik * .BED atau * format file .GFF untuk lebih lanjut survei dengan UCSC lagu peramban informasi. Hasil pemetaan dapat dilihat dalam skala yang diinginkan, dari grafik kedalaman membaca lebih kromosom seluruh untuk keberpihakan urutan rinci antara membaca dan urutan referensi. Pengguna dengan mudah menavigasi ke daerah bunga hanya melalui klik dan tarik atau bergulir. ZOOM Lite merupakan turunan dari perangkat lunak ZOOM Studio
Apa yang baru dalam rilis ini:.
Versi 1.5 mencakup Format SAM ekspor, arsitektur menyesuaikan, optimasi kode yang lebih baik, lebih kecil Program ukuran biner, dan upgrade dabase engining untuk kinerja yang lebih baik.
Komentar tidak ditemukan